sed是一个在linux下很好用的文件处理工具,主要是以行为单位进行处理,可以将数据行进行替换、删除、新增等。 参...[作者空间]
seqLogo seqLogo是1990年发表的一个可视化工具,还是基于grid作图的工具。可以输入从MEME,J...[作者空间]
1.tar 压缩:tar -zcvf 文件名.tar.gz 待压缩的文件名tar -jvcf 文件名.tar.bz...[作者空间]
卸载旧版本的Docker 安装 Docker Engine-Community 1.需要设置 Docker 仓库,...[作者空间]
在python中读取、处理文件可以用pysam这个包。以下简单介绍一下这个包的使用。 读取文件 仅读取某条染色体某...[作者空间]
ENA数据库:European Nucleotide Archive:隶属EBI (European Bioinf...[作者空间]
Aspera下载和安装 Aspera下载: http://downloads.asperasoft.com/con...[作者空间]
有时候一个文件中有几十万个甚至更多子文件的情况下,就算这个文件不大,可能只有几G的情况下,用rm -rf 仍然很慢...[作者空间]
bedtools intersect可以对两个基因组特征 (genomic features) 进行overlap...[作者空间]
root下面安装全局的JDK 以debian为例debian下载jdk:https://download.orac...[作者空间]
现在ChIP-seq的数据基本是最常见的测序数据类型之一,主要有Transcription factor ChIP...[作者空间]
ggpubr是基于ggplot2的一个作图包,在画图的时候比较省事,用一行代码可以做几行代码的事情。比如: 如果做...[作者空间]
vcf格式是做变异(variant)分析的时候最常见的一种格式,主要包括一些header和位点的信息。可以参考这个...[作者空间]
PAGODA全称pathway and gene set overdispersion analysis,pago...[作者空间]
seaborn中实现scatterplot的主要参数seaborn.catplot(x=None, y=None,...[作者空间]
箱型图也是我们常用的图之一,如何用Seaborn实现箱型图呢? 与之相关的函数seaborn.boxplot的具体...[作者空间]
对于习惯使用python的朋友,可以考虑用seaborn库画图,方便高效。 对于热图,可以考虑使用seaborn....[作者空间]
GSEA的介绍:https://www.omicsclass.com/article/230GSEA有相应的软件,...[作者空间]
awk在处理文件的时候,常常比编写脚本更加方便,处理速度也更快,下边总结了一些awk的常用用法。 现在新建两个文件...[作者空间]
最近逛twiiter的时候,偶然发现有位老姐分享了关于植物的生信培训课程。 点进去地址的时候,发现是这个样子的。可...[作者空间]