Step 1,使用序列比对工具进行序列比对，这里笔者用的mafft（官网说明：https://mafft.cbrc...[作者空间]
写在前面：我是想着给课题组师弟师妹们培训出的一些例题。哈哈哈，没想到也难到了自己，因此花上了一些时间思考着这些平时...[作者空间]
miRNA是一类长约22 nt的非编码小RNA。miRNA通过碱基互补配对结合到靶mRNAs 3’UTRs以调控数...[作者空间]
VCF可以通过不同的上游分析获得，在格式上又有一些不同，盲目转化会带来很多问题。查看VCF文件内容可知是通过GAT...[作者空间]
写在前面 不出意外，6月，会把「TBtools」与群体遗传数据分析相关的系列插件，逐个释放。今天释放第二个，主要用...[作者空间]
对应书本第二部分第5章Pandas高级操作第3节 数据排序是指按一定的顺序将数据重新排列，帮助使用者发现数据的变化...[作者空间]
对应书本第二部分第5章Pandas高级操作第2节 在开始数据分析前，我们需要为数据分配好合适的类型，这样才能够高效...[作者空间]
vcf-merge 的方法： 1. gatk mergVcf gatk MergeVcfs -I M11189W....[作者空间]
主要使用blupADC[https://qsmei.netlify.app/zh/post/2021-04-21-...[作者空间]
GATK HaplotypeCaller结果vcf文件(V4.2标准) 示例 CHROM：表示变异位点是在哪个co...[作者空间]
这次分享的是1000基因组项目联合会在2012年发表在Nature (IF:49.962, 2020) 上的文章A...[作者空间]
建库 -in：待格式化的序列文件-dbtype：数据库类型，prot或nucl-out：数据库名 比对 -quer...[作者空间]
github在2020/10/1宣布上的所有新库都将用中性词「main」命名，取代原来的「master」，如果我们...[作者空间]
一、树型控件TreeView概述： （1）用于显示具有层次结构的数据 （2）由层叠的节点（Node）分支构成，每个...[作者空间]
老板就是上帝 上帝说要有光，于是就有了光 导师说要有可视化结果，于是我努力把结果可视化~ 前情提示 为了知道测序r...[作者空间]
—— 从一无所知到前期工作准备妥当的整个学习路径，涉及到多篇文档，算是一篇流水账(在gatk4网站的文档海洋中漫游...[作者空间]
前言：读书的时候曾经天天接触blast的网页版，在序列比对算法中，论速度，blast绝对是名列前茅的，借着这次工作...[作者空间]
目的： 当你想可视化你所研究的数据在染色体上分布，可能会用到RIdeogram来画类似的图。如何整理成要求的输入文...[作者空间]
序列比对定义 序列比对（特别是pairwise alignment）是指以某种方式排列两个序列，对齐具有相似性的区...[作者空间]
Needleman-Wunsch算法和Smith-Waterman算法分别对应全局比对和局部比对，这两个生物序列比...[作者空间]
