我管理的基因组学群里，今天有人提出了这样一个问题，如果有多个版本的BLAST，并且都是用conda安装，应该如何调...[作者空间]
名词解释 Graph：将小片段的基因序列进行连接，形成一个非常大的图。 构建Graph的方法： OCL(overl...[作者空间]
之前写过一篇文章Fastq-dump: 一个神奇的软件， 详细介绍了fastq-dump的用法。虽然fastq-d...[作者空间]
关键词：pacbio; nanopore; assemble wtdbg相较于其他三代四代数据组装软件（Canu，...[作者空间]
—————— 持续更新 关键词：Genome Size Estimation; Kmer 一.Kmer评估法简介 ...[作者空间]
基因功能的注释依赖于上一步的基因结构预测，根据预测结果从基因组上提取翻译后的 蛋白序列 和主流的数据库进行比对，完...[作者空间]
基因组survey 在组装基因组之前一定要先对要组装的物种有一个大致的了解，判断其复杂程度, 标准如下 简单基因组...[作者空间]
简化基因组的方法一定要问清楚 建库前无论公司说的是RAD-seq，还是说的是GBS，都不要太当真，因为这两个名词定...[作者空间]
MaSuRCA: 混合组装工具 适用于二代和三代混合组装，也可以就只装二代数据。 官方提示：使用原始数据，不做任何...[作者空间]
前段时间第一次拿到200多个群体的测序数据，准备对这些数据分析，然后就遇到自己以前分析几个样本不会遇到的问题：il...[作者空间]
基因组组装 基因组组装一般分为三个层次，contig, scaffold和chromosomes. contig表...[作者空间]
经过了第四节的长文，我想大家基本上已经知道了一个WGS流程该如何构建起来了吧。但在那一节中限于篇幅有两个很重要的文...[作者空间]
这篇文章很长，超过1万字，是本系列中最重要的一篇，因为我并非只是在简单地告诉大家几条硬邦邦的操作命令。对于新手而言...[作者空间]
从这一节开始详细讲述正式流程的搭建，我将结合具体的例子努力争取将这个系列写成比GATK最佳实践更加具体、更具有实践...[作者空间]
在WGS数据的分析过程中，我们会接触到许多生物信息学/基因组学领域所特有的数据文件和它们特殊的格式，在这一节中将要...[作者空间]
前言 基因测序已是时下热门，目前除了华大基因之外，其他分布于全中国的大型测序平台（HiSeq X 10）还有约10...[作者空间]
作为一个已经在生物信息行业摸爬两年的小白，还是有必要重新认识一下高通量测序领域的一些常用名词。什么是高通量测序？高...[作者空间]
什么是高通量测序？ 高通量测序技术（High-throughput sequencing，HTS）是对传统Sang...[作者空间]
纳米孔测序技术（又称第四代测序技术）是最近几年兴起的新一代测序技术。目前测序长度可以达到150kb。这项技术开始于...[作者空间]
