本文会持续更新,到华夏儿女可以乘共和国朝发夕至的高铁自由见证这片河山的美好之时! 前言 疫情肆虐之初,矜矜业业的科...[作者空间]
写在前面【后补的小恳请】 20号左右有几位学术败类蹭着热点,用着别人辛辛苦苦得到的数据,辜负了共享者为控制疫情节省...[作者空间]
在最最最开始!放上借鉴引用的文章链接!(后边还有)RNA-seq分析:从软件安装到富集分析详细过程RNA-seq实...[作者空间]
(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA) GSEA概念: GSEA:(基因集富集分析...[作者空间]
之前我们用热图的形式展现了相关关系,今天我们来用另外几种形式来展现相关关系的图。本文代码来源:Visualize ...[作者空间]
用“pheatmap"包画热图~ 高级绘图 1. 这是最简单的一张热图 pheatmap(Heatmapdata,...[作者空间]
写作之友 基因和基因簇的功能谱 (functional profiles) 的统计学分析及可视化 G Yu, LG...[作者空间]
富集分析方法 ORA Over-representation analysis过表达分析,常见的是GO富集分析和K...[作者空间]
RNA-seq分析流程 不得不提的一篇文献Sahraeian, Sayed Mohammad Ebrahim, e...[作者空间]
pheatmap参数: mat 数组矩阵(要绘制热图的数据源,保证数据是numeric类型) color 热图的颜...[作者空间]
superqun 原创于简书 手工目录: Q1:如何在肺癌数据库中选出k-ras突变的病人样本。 1. 使用GDC...[作者空间]
1 Hisat2 hisat2-build不支持压缩文件,运行完成后,生成后缀名为ht2的8个文件。 2 BWA ...[作者空间]
实验设计 实验目的决定试验方法和途径。试验目的 :获取三阴性乳腺癌的正常组织和癌症组织的基因表达差异情况,比较三阴...[作者空间]
持续更新ing.....最后更新时间:2019/3/8 10:28 AM 1.linux命令 1.1 linux...[作者空间]
STAR 软件安装 软件的GitHub地址为https://github.com/alexdobin/STAR, ...[作者空间]
最近读到一篇博文,介绍了学习 RNAseq 数据分析非常推荐的两篇综述和七个在线教程并发表了相关评论。本文将进行简...[作者空间]
superqun原创 一、流程概括 RNA-seq的原始数据(raw data)的质量评估 linux环境和R语言...[作者空间]
欢迎关注”生信修炼手册”! rmats是目前使用的最广泛的可变剪切分析软件,该软件不仅可以识别可变剪切事件,还提供...[作者空间]
知识线索 我们今天介绍统计学中的零假设和显著性检验的概念。我们人类容易盲目轻信,习惯在没有联系的事物之间想象出因果...[作者空间]
随着公共数据库的建立和开放,越来越多的研究者可以接触到测序数据,非常适合想我们这种“三无”研究者(无课题,无经费,...[作者空间]