1. 数据来源于这个网站,下载水稻所有RNA-seq数据 2. 准备自己的基因IDs文件, 注意基因是一行,而且空...[作者空间]
clusterProfiler 是业界大神Y叔写的一个R包,可以用来做各种富集分析,如GO、KEGG、DO(Dis...[作者空间]
转载的生信技能书的文章,仅用于自己学习记录! 文章原链接为:http://www.bio-info-trainee...[作者空间]
写在前面 转录组通常被用来寻找差异基因,但是有的时候我们想看一下已报道的基因是否存在可变剪切现象,即新转录本的挖掘...[作者空间]
bedtools批量提取基因组指定位置序列 之前已经介绍过很多提取序列的方法,有脚本的也有软件的,这里再介绍一种方...[作者空间]
按:RNA-seq 流程非常多样化,每一个步骤可选工具都非常多。我的选择是 StringTie 进行组装取得 re...[作者空间]
一、安装软件 1、HISAT2 将reads比对到基因组上 2、StringTie 将比对好的reads进行拼装并...[作者空间]
http://www.metagenomics.wiki/tools/blast/evalue E值 BLAST ...[作者空间]
作为一个生物学湿试验僧,颠来倒去地捣鼓ATCG是不可避免的。而且发表论文中示意图的绘制也是很重要。回想起当时年幼,...[作者空间]
[序列比对和序列特征分析总目录](https://www.jianshu.com/p/878f2b2495ae 蛋...[作者空间]
写在前面,其中的一些具体原理包括算法以后或许会详细添加。主要参考主源自李霞老师主编《生物信息学理论与医学实践》,陈...[作者空间]
BWA (Burrows-Wheeler Aligner) BWA主要是将reads比对到大型基因组上,主要功能是...[作者空间]
Pathway Analysis讨论及基因富集分析软件(Gene Set Enrichment Analysis,...[作者空间]