作为一个生物学湿试验僧,颠来倒去地捣鼓ATCG是不可避免的。而且发表论文中示意图的绘制也是很重要。回想起当时年幼,听前辈的话用PPT绘制的基因组结构示意图。如今想来,自己真是太年轻(下图C)。怎么说来着?君子是善于利用外在条件(譬如,现成的软件)搞事情的。哈哈哈。
当然,绘制基因组结构的更高效的软件有一大把。只是,最近捣鼓DNAMAN时,解锁一个绘制序列结构图的功能,权且记录一番,作为入坑简书首发。
Characterization of a novel RNA virus from the phytopathogenic fungus Leptosphaeria biglobosa related to members of the genus Mitovirus | SpringerLink软件:DNAMAN 7
序列:真菌病毒LbMV1的全长序列
第一步,导入序列
第二步,在sequence中找到draw sequence map
箭头所示即为原始图样。我们双击空白区就可以调出调整选项。图中的文本可以点击进行简单的修改和拖拽哦。第三步,每个选项卡都去捣鼓吧,获得离想要的。
通过Site选择输入的起始密码子及位置,如箭头所示,通过添加空格使得密码子的第一个字母A能够与ORF起始边界对齐。同理,终止密码子在后面添加空格。第四步,成图
看着是丑些,估计还要精修。哈哈第五步,保存出图。
方法一:在软件的File-export EMF file即可得到.emf格式的图片文件
看着还行方法二:在软件中edit-copy map即可复制,可以直接Ctrl V到打开的Word等办公软件中
想把RdRp放到灰色框框上,发现被覆盖显示不了。结语
相比于PPT做图,DNAMAN在位置比例等方面更方便精准,但是在图形元素的位置大小调整上,相对弱鸡点。
这是半桶水晃荡的体验啦,哈哈。
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