细胞注释是单细胞转录组分析的重要环节,来自加拿大的研究人员在《Nature protocols》发表细胞注释教程综...[作者空间]
这里是佳奥!我们继续学习最重要的三个R包。 1 scater Package(calculateQCMetrics...[作者空间]
有人可能会说:单细胞分析使用Seurat,monocle等R包会更加方便。但是实际分析中,测试情况是当细胞量大于5...[作者空间]
Seurat standard pipeline(10核心流程) 创建Seurat对象 Read10X Cr...[作者空间]
单细胞分析流程之Cell Ranger 相信做单细胞的小伙伴对Cell Ranger这个软件都不陌生,我们今天就来...[作者空间]
2021年12月29日,Journal of Genetics and Genomics在线发表国家基因库生命大数...[作者空间]
写在前面从NCBI下载的注释文件通常是gbff格式的,而我们平时做上游分析用到的大多数为gff或gtf文件,那么这...[作者空间]
写在前面 不少人应该知道,在生物模式,通路,调控机制上,PPT 已然是常规工具之一。类似的,那么画卡通热图,PPT...[作者空间]
hello,大家好,今天给大家分享的是,拟时序轨迹分析软件中对轨迹关键驱动基因的下游分析,挖掘拟时序分化轨迹开关基...[作者空间]
今天和大家分享的是2020年12月份发表在Molecular Therapy-Oncolytics杂志上的一篇文章...[作者空间]
今天和大家分享的是今年7月份发表在Cancer Immunology, Immunotherapy杂志(IF=5....[作者空间]
今天是2019月12月3日,10X空间转录组的新流程发布了,比起安装旧版的ST Spatial系列好装了太多太多。...[作者空间]
目前单细胞测序获取细胞的方法主要有两种:(1)Smart-seq:测序细胞量少(因为一次通过一个细胞),但是测序的...[作者空间]
写在前面 很久以前,我们推出《热图,还只会用方格子?@所有人,论文热图升阶的时候到了!》这一功能。目前已有一定的用...[作者空间]
三个关键字,国内,高通量和转录组一个网页工具: http://wanglab.sippe.ac.cn/rootat...[作者空间]