文章信息: 文章题目:Integrated single-cell profiling dissects cell...[作者空间]
今年1月2022Nucleic Acids Research生物数据库特刊上线,包含185篇文章:其中87篇论文报...[作者空间]
说在前面 在中国科研界,有一位大名鼎鼎的老师只用了短短5年就发了十几篇CNS期刊文章,他的研究方向不仅横跨生物信息...[作者空间]
在项目取子集后,需要对所取细胞子集进行重新聚类分群,这里提供简洁的流程代码。 对于最佳PC数量的选择建议结合,先前...[作者空间]
本目录为单细胞相关分享索引,持续更新.... 1.上游数据处理 01.单细胞测序上游-数据下载(适用于图形化界面)...[作者空间]
筛选标准 1.主成分累积贡献大于90%2.PC本身对方差贡献小于5%3.两个连续PCs之间差异小于0.1% 转载来...[作者空间]
分析单细胞转录组测序的软件和方法有很多,最流行的莫过于Seurat包,可以完成单细胞分析整个流程,我们整个教程也是...[作者空间]
从读取数据开始。 Read10X ()函数 读取 cellranger pipeline输出的10X单细胞数据,...[作者空间]
hello,新的一周,周一是开始,不知道大家感觉2022年初怎么样呢???是不是觉得很不错???不过我工作了几年领...[作者空间]
1.准备输入数据 输入数据是肿瘤样本表达矩阵exprSet、临床信息meta 2.构建随机森林模型 输入数据是表达...[作者空间]
前言 Immugent在之前的推文:整合多组学数据进行分型之MOVICS[https://mp.weixin.qq...[作者空间]
前言 读《Cell type prioritization in single-cell data》[https:...[作者空间]
本公众号最新的单细胞推文目录: 分析 单细胞分析实录(1): 认识Cell Hashing[http://mp.w...[作者空间]
scWGCNA是一个生物信息学工作流程,是R包WGCNA[https://horvath.genetics.ucl...[作者空间]
1.R程序并行运算和调整R内部允许的对象大小的限制 默认是500 * 1024 ^ 2 = 500 Mb futu...[作者空间]
1.如何通过Seurat对象获取细胞对应的坐标? 2.如何通过Seurat对象获取原始表达数据? 3.提取特定基因...[作者空间]
hello,大家好,我们的分析也慢慢进入深水区了,很多方法需要联合起来使用,如何灵活运用各种方法,就需要我们的经验...[作者空间]
3-10分的文献思路介绍 【蛋白质组学】技术介绍 蛋白质组学技术于1996年由澳大利亚学者Wilkins等最早提出...[作者空间]
10x Visium空间转录组技术继问世以来便受到了科研人员的青睐,已广泛应用于发育生物学、神经生物学、肿瘤生物学...[作者空间]
文章概览 题目:Single-Cell RNA-Seq Analysis of Infiltrating Neop...[作者空间]