RNAseq是一种高通量测序技术。它可以帮助我们理解在各种比较条件下，所有基因的表达情况的差异。可以检测的差异有：...[作者空间]
这篇文献学习笔记分享的是一篇有关于增强子和启动子的综述。文章在今年2月发表在了Nature Reviews Gen...[作者空间]
甲基化问题锦集 今天和大家聊聊甲基化。 问：什么是表观遗传修饰？ 答：基因组表观遗传修饰主要包括DNA甲基化修饰与...[作者空间]
之前的文章里已经按照教程进行了TCGA数据库的一些练习（RNA-seq、芯片、生存分析），现在学习TCGA甲基化数...[作者空间]
NES>0, 激活NES <0, 抑制 facet_grid(~.sign)命令[作者空间]
文献题目：Interrogation of Enhancer Function by Enhancer-Targe...[作者空间]
基因表达差异分析是我们做转录组最关键根本的一步，edgeR+limma是目前最为推荐的方式。本文结合示例数据，将对...[作者空间]
刘小泽写于19.12.29 + 2020.1.1这一篇不扯别的，只列我认为比较重点的limma包的知识，所以代码部...[作者空间]
这个数据集是来自GSE106292.关于PCA之前都是都是不是零或者是零但是肉眼不可见的矩阵，但是这次的测序数据一...[作者空间]
缺失值可视化 1.在GEO数据挖掘过程中，有时取子集会导致生成的子集都是NA。那么是因为代码写错了，或者数据类型没...[作者空间]
关于用getGEO下载数据后，会得到一个list，取出第一个列表中的元素后，再查看这第一个元素的数据类型后，发现他...[作者空间]
GSE44077 数据集是GSE44077，pd信息经过取冗余处理后得到了226行，11列的数据。 第一个疑问，如...[作者空间]
Bisulfite Conversion 这里我们注意3种DNA链： 1、Watson链和Crick链（名字不代表...[作者空间]
1917年，Morgan及其同事在突变的果蝇中发现Notch基因，因该基因的部分功能缺失会在果蝇翅膀的边缘造成缺刻...[作者空间]
血红素加氧酶（HO）催化血红素氧化降解为胆绿素，亚铁和一氧化碳（CO），HO-1具有多种生物学作用，如血红素解毒，...[作者空间]
文献讲述的是P53的特异激活剂Nutlin-3a诱导LncRNA linc00086（下称LED）基因表达后富集在...[作者空间]
看到有人喷老大，说话很难听，看见了，忍下了，啥也没说，语言太苍白无力了，尤其像我这种微不足道的人说话更没有什么分量...[作者空间]
这是我听孟浩巍知乎Live：生信进阶第1课-重复Nature文章和B站视频：高通量测序技术交流录像里的笔记哦~ 目...[作者空间]
刘小泽写于18.10.26今晚10.15开始写，先写这么多吧，明天继续 第一部分 背景介绍 选用GEO数据：GSE...[作者空间]
