featureCounts是一个用来统计count数的软件，运行的速度飞快，比之前用的htseq-count快了好...[作者空间]
全基因组关联研究（GWAS）已经确定了数千种与许多复杂特征相关的遗传变异。然而，它们的生物学机制在很大程度上仍然是...[作者空间]
加权基因共表达网络分析 (WGCNA, Weighted correlation network analysis...[作者空间]
传统的富集分析的步骤是： 计算出差异表达基因列表 运行GO 运行KEGG当然，也可以运行其他富集分析，比如DO，W...[作者空间]
1 建索引 2 比对(若用于GATK，可不排序输出sam文件) 1)常规比对（一次2个吧, 用于差异分析） 2-p...[作者空间]
欢迎关注Bioinfor 生信云！ 上一篇推文讲了bulk RNA-Seq 的数据清洗部分，接下来就是将清洗后的数...[作者空间]
对RNAsq的read count数据进行PCA分析 目的：PCA分析可以得到样本之间的相关性和离散程度。 内容：...[作者空间]
前言 康奈尔大学，FeiLab的一个预测工具。 iTAK 是依赖于数据库的用于从蛋白质或核苷酸序列中识别植物转录因...[作者空间]
差异基因筛选的常见方法有edgeR, DEseq2, EBseq等，这篇文章主要介绍DEseq2。 官方网站：ht...[作者空间]
写在前面 很多时候，我们做完转录组，会想着看看样品与样品之间的表达相关性如何？依此，可以看看是否存在异常样品，也或...[作者空间]
本系列为 RNA-Seq 分析具体实现过程，将具体描述流程及可执行代码～本次复现文章来自 Nature comm...[作者空间]
以前写过不少零散的 RNA-Seq 分析文章，现在整理为流程，同时修改一些错误。流程包含质控、比对、定量、差异分析...[作者空间]
RNA-seq中的基因表达量计算和表达差异分析 原文链接：RNA-seq中的基因表达量计算和表达差异分析-生物知识...[作者空间]
hello，周四了，时间怎么过的这么快呢？？我的记忆还停留在刚过完年拔充电线的那一刻，时间啊，慢些吧，想静静的感受...[作者空间]
DESeq2对logFC会有一个shrink的过程，我们以apeglm为例：step 1：创建deseq对象 st...[作者空间]
全网最全 GO 注释结果绘图，直击 SCI 绘图标注，关注我，您最好的选择！ 前言 1. GO 原理 基因组测序已...[作者空间]
文章目录 加载R包和输入数据 表达数据整理3.edgeR包做差异表达4.limma包做差异表达5.DESeq2包做...[作者空间]
受人之托，所以又跑到另外一个领域去了，中文的资料还不是很全，所以还是自己动手吧 可变剪切工具大全 HussainA...[作者空间]
前言：今天在图形绘制教程是，无意间看到两篇相对较好的教程，自己觉得写的还是比较详细的，以及我们做生物信息学数据分析...[作者空间]
