AnnotSV地址:https://lbgi.fr/AnnotSV/[https://lbgi.fr/AnnotS...[作者空间]
NC文章的全基因组部分,关于GWAS的一些图本来不想复现,但是看到近期很多文章包括单细胞总是会挖掘GWAS用于自己...[作者空间]
一、何为GWAS? GWAS(Genome-wide Association Study)是对多个个体在全基因组范...[作者空间]
值得一提的是CNVkit设计的出发点是可以针对hybridization原理的NGS数据进行分析,把on-targ...[作者空间]
目录 前言[https://www.jianshu.com/p/729673778e43] 方法简介[https:...[作者空间]
众所周知,基因组分析的软件为了效率进行大规模的计算处理,大多数是基于C++。这对于用惯了R语言的同学就很不友好了。...[作者空间]
读取和汇总gistic输出文件 maftools : Summarize, Analyze and Visuali...[作者空间]
前言 众所周知,一般GWAS分析中SNPs都是上几十万个的, 但是样本顶多也就几千个嘛(1980个新冠患者GWAS...[作者空间]
格式 VCF是Variant Call Format的简称,该格式文件是专门用于存储基因序列突变信息的一种文本文件...[作者空间]
前言 时间过的真快,一转眼距离上一次发帖已经过去两周的时间,不知道这两周时间自己都忙了些啥,时间就没有了。真的...[作者空间]
1、GWAS4D 网址:http://mulinlab.tmu.edu.cn/gwas4d 2、SNPnexus ...[作者空间]
可重复的生信分析一直是未来的趋势。如果实现可重复的生信分析,关键在于分析软件版本的控制,一致的环境设置还有良好的分...[作者空间]
甲基化基础知识 基础知识甲基化是表观修饰的一种表观遗传修饰是指对基因组功能的相关修饰,通过一系列生物学修饰改变基因...[作者空间]
最近要处理一些基因注释的文件,要用到bedtools这款经典的软件,在慢慢接触到这款软件才发现其功能的强大之处,在...[作者空间]