WGCNA全称weighted gene co-expression network analysis,即加权基因...[作者空间]
定量方法 Kurtosis measure(峰度) 统计学中,峰度(Kurtosis)衡量的是随机变量概率分布的峰...[作者空间]
对RNAsq的read count数据进行PCA分析 目的:PCA分析可以得到样本之间的相关性和离散程度。 内容:...[作者空间]
前言 专题目的:粗暴,简单,直接套用 如果我们想知道成对测量值(均值)之间是否有差异,可考虑配对t检验。 本章配对...[作者空间]
GSEA缩写 GSEA的全称是Gene Set Enrichment Analysis, 中文翻译就是基因富集分析...[作者空间]
GSVA其实就是pathway级别的差异分析[https://www.jianshu.com/p/8817dbae...[作者空间]
降维 降维顾名思义就是把数据或特征的维数降低,一般分为线性降维和非线性降维,比较典型的如下: 线性降维:PCA(P...[作者空间]
1.目的 要把免疫细胞与某些基因计算相关性,并画出热图,例如(图) 2.思路 其实就是把完整的相关性矩阵切出一部分...[作者空间]
随着测序技术的发展,每年测序数据量以PB级增长。随着海量测序数据的增长,越来越多的研究人员开始挖掘公共数据库中的测...[作者空间]
setwd("E:/GSE25066")#环境设置 library(limma)#加载差异分析包limma #将分...[作者空间]
http://www.sthda.com/english/wiki/correlation-test-betwee...[作者空间]
## 如何了解一个数据框 ## 看头 head(exprSet) ##前6行 head(exprSet)[,1:5...[作者空间]
刘小泽写于19.6.14-15笔记目的:根据生信技能树的单细胞转录组课程探索smart-seq2技术相关的分析技术...[作者空间]