Cytoscape使用资源

Cytoscape App Store https://apps.cytoscape.org/

一、cytoscape的十大插件

https://mp.weixin.qq.com/mp/appmsgalbum?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&action=getalbum&album_id=1844437618248187909&scene=173&from_msgid=2247489504&from_itemidx=2&count=3&nolastread=1#wechat_redirect

二、使用技巧

1、APT干货||Cytoscape展示String互作数据实战教程（二） https://www.sohu.com/a/148545313_465960

2、GEO数据挖掘小尝试：（二）蛋白质互作网络分析 - 简书 https://www.jianshu.com/p/80910dc0857f
3、STRING网站+Cytoscape软件制作精美蛋白互作网络图(PPI) - 云+社区 - 腾讯云 https://cloud.tencent.com/developer/article/1437752
4、STRING Cytoscape 网络互作图 - 走看看 http://t.zoukankan.com/0820LL-p-11417065.html
5、如何利用网络图给自己转录组数据的文章添彩 https://mp.weixin.qq.com/s/N9GZVj3r0WOZbNzAx02pBQ（有代码）
6、基因共表达网络图和蛋白互作网络图分不清楚？ https://mp.weixin.qq.com/s/W4uTku77nQ-aYmBgLlcuFA
7、超简单的蛋白相互作用网络图 https://mp.weixin.qq.com/s/HkJsxDQXBrNSKQWah9tlcA
8、Cytoscape 做基因和蛋白质互作网络图 https://mp.weixin.qq.com/s/HDGz7FF48pLmi3rJiHv2QQ
9、老司机带你解锁蛋白质互作网络分析 https://www.zhihu.com/column/p/252732704?utm_medium=social&utm_source=weibo
10、信号通路、蛋白互作绕的头晕？这篇文章全搞定 https://mp.weixin.qq.com/s/8EXmhtt3zSIyQfCWhzA7FQ

11. Analyzer — Cytoscape User Manual 3.9.0 documentation http://manual.cytoscape.org/en/stable/Network_Analyzer.html

12、NetworkAnalyzer Help https://med.bioinf.mpi-inf.mpg.de/netanalyzer/help/2.7/index.html#degreeDist
13、D3: Computational Biology & Applied Algorithmics: Software: NetworkAnalyzer https://med.bioinf.mpi-inf.mpg.de/netanalyzer/index.php
14、Home · cytoscape/cytoscape-tutorials Wiki · GitHub https://github.com/cytoscape/cytoscape-tutorials/wiki