Cell文章 中单倍型的地理分布图绘制步骤之数据下载

SNP数据下载
该网站提供水稻(Oryza sativa L.)的基因型、表型和品种信息。SNP基因分型数据(对照Nipponbare- reference Os-Nipponbare-Reference-IRGSP-1.0)来自3000水稻基因组计划。这3000个水稻品种的表型和护照数据来自国际水稻基因库收集信息系统(IRGCIS)。我们是国际水稻信息学联盟(IRIC)正在进行的一项工作的一部分，该工作旨在集中对水稻研究数据的信息访问，并提供计算工具，通过发现新的基因性状关联和加速育种来促进水稻改良。

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做水稻的同学应该不陌生，做单倍型，gwas数据分析，表型查找必备网站。网址：https://snp-seek.irri.org/index.zul

如何下载呢？

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紧接着输入LOC_OS06G03810，小伙伴可以根据自己的研究替换目的基因即可：

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根据需要下载CSV格式文件即可，下次再讲如何绘制单倍型分布图。

今天就先给大家介绍到这里，希望大家的科研能有所帮助！祝您科研顺利快乐！

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