library(homologene)
#find mouse_human homologic genes
options(stringsAsFactors = F)
genames<-rownames(data)
#@inTax是输入的基因列表所属的物种号，10090是小鼠
#@outTax是要转换成的物种号，9606是人
ge_convert <- homologene(genames, inTax = 10090, outTax = 9606)
ge_human<-ge_convert$`9606`
library(homologene) #find mouse_human homologic genes opt...
适用背景 当我们进行跨物种比较分析时会发现基因名对不上，或者找不到基因，这时候就需要进行物种间的同源基因转换。最常...
基因家族聚类： Inparanoid MSOAR OrthoMCL HomoloGene 进化树： TreeFam...
可能常见的转换是小鼠和人之间的转换，因为小鼠的基因和人的基因的同源性，约80%的小鼠蛋白质在人类基因组中具有严格的...
https://www.jianshu.com/p/05554a7aeaf8 快速实现人和小鼠之间的同源基因转换 ...
适用背景 之前写了一篇跨物种同源基因转换[https://www.jianshu.com/p/abf5138e37...
Homolog genes 同源基因是来自一个共同个祖先DNA序列的genes。不同物种中的同源基因指的是直系同源...
Homolog是同源基因。 Orthologs,Orthologues 直系同源，是指不同物种之间的基因，起源于...
基因家族扩张和收缩分析 基因家族的扩张和收缩分析一般会使用orthoMCL进行同源基因识别，然后选择直系同源基因进...
OrthoFinder 输出文件说明 OrthoFinder 的标准输出包括：直系同源组，直系同源基因，有根基因树...
本文标题：homologene同源基因转换
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/auavyrtx.html
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