小鼠和人gene转换

作者: 一只小脑斧 | 来源:发表于2022-05-30 10:20 被阅读0次

https://www.jianshu.com/p/05554a7aeaf8

快速实现人和小鼠之间的同源基因转换

#安装homologene这个R包

install.packages('homologene')

#加载homologene这个R包

library(homologene)#这里以小鼠的三个基因为例#更多基因方法是一样的

genelist<-c("Acadm","Eno2","Acadvl")

#使用homologene函进行转换#@genelist是要转换的基因列表#@inTax是输入的基因列表所属的物种号，10090是小鼠#@outTax是要转换成的物种号，9606是人

homologene(genelist,inTax=10090,outTax=9606)

小鼠和人gene转换
https://www.jianshu.com/p/05554a7aeaf8 快速实现人和小鼠之间的同源基因转换 ...
biomaRt包实现不同物种之间同源基因转换
可能常见的转换是小鼠和人之间的转换，因为小鼠的基因和人的基因的同源性，约80%的小鼠蛋白质在人类基因组中具有严格的...
2021-04-08 探针与基因id的转换
探针id和gene id的转换
PCA降维原理
如果我们在6个小鼠样本中检测一个基因Gene1的表达我们很容易看出来，基因Gene1在小鼠1-3中表达比较相似，...
基因id转换
gene symbol 与 entrezid 转换
gene name和gene ID之间的转换
在实际应用中，我们经常需要在gene name和gene ID之间进行转换。当需要处理的基因数量很少时，我们可以直...
RNA-seq分析（四）pathway analysis
1. Gene_ID转换手动把差异表格中基因那一列（如gene-Q0020，gene-替换掉），在gene_i...
Gene ID转换
LIBRARY(ORG.HS.EG.DB) 人共有多少个entrezid的基因呢？ x<-org.Hs.egENS...
R中如何将ENSEMBL ID转换成Gene ID(ENTREZ
方法一在R中如何利用ENSEMBL ID获得Gene ID(ENTREZID), 又或者转换为Gene Symb...
R-基因名转换
SYMBOL命名转换为ENSEMBL命名可以得到gene文件