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学习小组Day3笔记--liull

学习小组Day3笔记--liull

作者: liu_ll | 来源:发表于2018-12-05 21:58 被阅读21次

今天学习的是如何安装软件,conda,这个软件很好用,之前也是我一直在用的。但是因为我们服务器上的home目录和自己的工作目录不是一个,conda有时候装软件位置会错,虽然可以修改安装地址,但是我还是没用的特别的习惯。再次重温及阅读啦~感谢花花的贴心推荐了。


miniconda的学习.png

贴上代码

第一步 下载:wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
第二步  安装:sh https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
第三步  修改目录![修改安装目录](https://img.haomeiwen.com/i14720037/fce3b6589e0b9025.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240)
第四步  设置镜像   conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --set show_channel_urls yes
第五步   搜索下载软件  conda search fastqc /   conda install fastqc
第六步   修改环境变量  conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
第七步     激活环境变量   conda activate -n rna-seq

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