ST Pipeline||空间转录组分析流程

ST Pipeline: an automated pipeline for spatial mapping of unique transcripts

我们终于可以看到单个细胞在组织中的状态了，细胞生物学开启spatial + 时代，spatial + 转录组/蛋白组/代谢组，然后是空间多组学。想想都怕，安心读文献。

SPATiAL pipeline

其实看到这个pipeline的最后那张表我们就不怕了，就是把之前的单细胞的cell-gene矩阵转化为xy-gene的矩阵，在其中xy是cell的坐标，那么有单细胞分析经验的小伙伴不是得心应手了吗，分析方法可以用了呀。

ST Pipeline: an automated pipeline for spatial mapping of unique transcripts
st_pipeline||github
10X spatialtranscriptomics