安装cufflinks

#最新版
wget http://cole-trapnell-lab.github.io/cufflinks/assets/downloads/cufflinks-2.2.1.Linux_x86_64.tar.gz
tar zxf cufflinks-2.2.1.Linux_x86_64.tar.gz
#设置环境变量
sudo vi /etc/profile

export PATH=$PATH:/home/zhiwufy/cufflinks-2.2.1.Linux_x86_64

GFF3与GTF格式相互转换

#gff2gtf
gffread my.gff3 -T -o my.gtf
#gtf2gff
gffread merged.gtf -o- > merged.gff3

Cufflinks安装与GFF和GTF格式转换
安装cufflinks GFF3与GTF格式相互转换
gff和gtf之间转换
用gffread进行转换 1.gff格式转gtf 2.gtf转gff
山羊转录组GFF文件与GTF格式转换
GFF文件与GFF文件来源 1.1 GFF文件来源 1.1 GTF文件来源 GFF文件与GTF文件格式 2.1 ...
基因组注释文件(GTF/GFF)格式介绍
基因组注释文件GTF/GFF格式的介绍 GFF 2 -> GTF -> GFF 3 The GTF ...
cufflinks使用（2018-05-28）
使用Cufflinks里面的工具gffread 执行命令：gffread **.gff-T -o **.gtf ...
gff格式与gtf格式转换——gffread
gff和gtf格式都可以储存基因信息，但是不同的软件对于文件格式的要求不同。关于gff文件和gtf格式的详细介绍...
gffread处理工具
GFF/GTF格式 01 格式 1.GFF（general feature format ): 通用特征格式，格式...
NCBI gff/gff3 转换为 gtf 格式
适用于 NCBI 数据库中 gff 格式文件转换为 gtf 格式，使用 perl 代码实现：
gffread软件使用教程
gffread 不仅可以实现GTF与GFF的互相转换，而且还可以对GFF文件进行过滤处理。可以直接读取GTF文件。...
annovar：使用gff文件自建数据库注释
1、gff文件转换gffread：将gff文件转换为gtfgtfToGenePred：将gtf转换为GenePre...