用gffread进行转换
1.gff格式转gtf
gffread A.gff -T -o A.gtf
2.gtf转gff
gffread A.gtf -o A.gff
用gffread进行转换 1.gff格式转gtf 2.gtf转gff
1、gff文件转换gffread:将gff文件转换为gtfgtfToGenePred:将gtf转换为GenePre...
gffread 不仅可以实现GTF与GFF的互相转换,而且还可以对GFF文件进行过滤处理。可以直接读取GTF文件。...
安装cufflinks GFF3与GTF格式相互转换
基因组注释文件GTF/GFF格式的介绍 GFF 2 -> GTF -> GFF 3 The GTF ...
gff2gtf gffread my.gff3 -T -o my.gtf gtf2gff gffread merg...
GFF文件与GFF文件来源 1.1 GFF文件来源 1.1 GTF文件来源 GFF文件与GTF文件格式 2.1 ...
使用cufflinks进行转换 但是这个有个局限性就是只能转换mRNA的gff文件,因为它识别的特征是exon,g...
使用gffread #gff2gtfgffread my.gff3 -T -o my.gtf#gtf2gffgff...
gff和gtf格式都可以储存基因信息,但是不同的软件对于文件格式的要求不同。 关于gff文件和gtf格式的详细介绍...
本文标题:gff和gtf之间转换
本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/nnfportx.html
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