代码示例：
1. single_rarefaction.py -i OTU_table.biom -o OTU_table_even10000.biom -d 10000
参数： -i 后接输入文件，通常为biom格式
-o 后接输出文件，即为稀释后的文件
-d 表示要稀释为的深度，即序列数，这里表示将每个样本稀释到10000个序列数
2. 将biom格式转为txt文本
/home/Hemaozhang/anaconda3/envs/qiime1/bin/biom convert -i OTU_table_even10000.biom -o OTU_table_even10000.txt --to-tsv --header-key taxonomy
参数： -i, -o 分别接输入输出文件
--to-tsv 指定了输入格式，这个参数一定要有，否则会报错
--header-ley taxonomy 表示在输出文件的最后一列加上微生物分类信息
最终生成如下文件：
代码示例： 1. single_rarefaction.py -i OTU_table.biom -o OTU_t...
一一坐寅山向申的可以做么？这是八运上山下水的立极！ 一一吉凶与什么坐向关连不大的，是由地势的来龙去水而定的。 一一...
凡物皆为用，过和不及都是问题。比如饭，吃多了撑，吃少了饿。平衡和适当为度。很多时候我们总是产生抱怨，其实一切的根本...
说的还是人才方面，有用与没用的问题。 据韩非《外储说右上》记载：“如耳说卫嗣公，卫嗣公说而太息。左右曰：‘公何为不...
中学，指的是中华传统圣贤的智慧之学。西学，是指西方国家发达的科技文明或科技工具。 从上图可以看出，中西方人的生命观...
佛说世界上一切都是有为法，有为法都不实在。但是有为法，体是无为，用是有为。所以我们想在有为法中，求无为之道...
鲜花用绽放为自己喝彩,翠竹用挺拔为自己喝彩,骏马用奔腾为自己喝彩,小鸟用欢歌为自己喝彩，大地用丰收为自己喝...
学之多、而无所用，乃纸上谈兵。基础之学，必学之。学之精髓而为所用。大方读书者，渴望博览群书，求知若渴，事之可理矣。
一直以来，学习不少，进步改变不大。 总结起来，一是思维没有改变，二是思想懒 惰。从今年上半年来看，动手多...
天象无形，道隐无名。夫唯道，善始善成。反也者，道之动；弱也者，道之用。 天的象没有形状，道看不见没有名字。只有道，...
本文标题：20171103-用single_rarefaction.py为
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/bpazpxtx.html
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