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常用TCGA数据下载及分析网站

常用TCGA数据下载及分析网站

作者: rapunzel0103 | 来源:发表于2019-12-16 12:53 被阅读0次

TCGA是个大宝库，有很多方便下载分析TCGA某一癌症RNA表达数据的网站，部分能直接出图（这些网站还有其他的功能，比如上传分析自己的数据）。这里给大家汇总一下（持续更新中），欢迎留言分享：

1、TCGA官网GDC
https://portal.gdc.cancer.gov/

2、cbioportal
https://www.cbioportal.org/

3、xena
[https://xenabrowser.net/datapages/?cohort=TCGA%20Pan-Cancer%20(PANCAN)&removeHub=https%3A%2F%2Fxena.treehouse.gi.ucsc.edu%3A443]


4、GEPIA
http://gepia2.cancer-pku.cn/
5、firebrowse
http://firebrowse.org/

6、The human protein atlas
https://www.proteinatlas.org/

当然，能从下载数据到分析出图一条龙的TCGA R包也不少，有时间再汇总

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    本文标题：常用TCGA数据下载及分析网站

    本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/bqornctx.html

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