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常用TCGA数据下载及分析网站

常用TCGA数据下载及分析网站

作者: rapunzel0103 | 来源:发表于2019-12-16 12:53 被阅读0次

    TCGA是个大宝库,有很多方便下载分析TCGA某一癌症RNA表达数据的网站,部分能直接出图(这些网站还有其他的功能,比如上传分析自己的数据)。这里给大家汇总一下(持续更新中),欢迎留言分享:

    1、TCGA官网GDC
    https://portal.gdc.cancer.gov/

    2、cbioportal
    https://www.cbioportal.org/

    3、xena
    [https://xenabrowser.net/datapages/?cohort=TCGA%20Pan-Cancer%20(PANCAN)&removeHub=https%3A%2F%2Fxena.treehouse.gi.ucsc.edu%3A443]


    4、GEPIA
    http://gepia2.cancer-pku.cn/
    5、firebrowse
    http://firebrowse.org/

    6、The human protein atlas
    https://www.proteinatlas.org/

    当然,能从下载数据到分析出图一条龙的TCGA R包也不少,有时间再汇总

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