Day 3—小夏

命令历史

上箭头

• 命令历史，输入的命令重新出现在提示符之后

下箭头

• 输入的命令消失

鼠标和光标

鼠标左键选中的文本会拷贝到缓冲区，点击右键会粘贴到新的位置

简单命令

date

• 显示系统当前时间和日期

cal

• 显示当前月份日历

df

• 查看磁盘剩余空间数量

free

• 显示空闲内存数量

exit

• 结束终端对话

文件系统中跳转

• pwd
  • 显示当前路径/工作目录名
• cd
  • 后接目录名，进入目录；后不接表示回到主目录
    • 绝对路径
      • 起始于根目录 eg. cd /home/bio02/a #到达a
      • 可先输入pwd输出当前路径，左键选中，右键复制
    • 相对路径
      • 开始于工作目录 eg. cd .. #到达该工作目录的父目录
      • .（点）指的是工作目录；..（点点）指的是工作目录的父目录

文件名规则

• 以“.”字符开头的文件名是隐藏文件，ls无法列出；ls -a命令可以列出
• 文件名和命令名的大小写是敏感的，“File1”和“file1”是两个不同的文件名
• 支持长文件名，“,”、“-”、“_”，最好用下划线代替空格
• file filename #调用file命令，输出文件内格式的描述
• less filename #查看文件内容；按q退出less程序

ASCII文本 美国信息交换标准码

符号链接

下载miniconda

• 在清华conda镜像网站

• wget 复制的下载链接

• bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

• source ~/.bashrc #激活conda

• 添加镜像

• conda install fastqc -y # 添加镜像后安装软件fastqc

• fastqc--help #输出一大篇文字则说明软件安装成功

conda环境

• conda info --envs #查看已有环境

• conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y #构建名为rnaseq的conda环境，指定的py版本是3

• conda activate rna-seq激活新的conda环境，*发生转移；运行conda deactivate则退出当前环境，

学会用复制呀！不要自己傻傻的输入

思维导图Day 3