samtools view LTR3-2_L4_P701501.bam | perl -alne '{print if $F[6] ne "="}' > unaligned.sam
包括未比对上的和比对到不同染色体的
cut -f 3,7 unpaired.sam |sort |uniq -c
samtools view LTR3-2_L4_P701501.bam | perl -alne '{print if $F[6] ne "="}' > unaligned.sam
包括未比对上的和比对到不同染色体的
cut -f 3,7 unpaired.sam |sort |uniq -c
samtools view LTR3-2_L4_P701501.bam | perl -alne '{print ...
将URL地址中的参数转换成对象 getUrl() 将参数转换成对象 getUrlK(K) 从转换后的对象中提取...
比如想提取20M reads （大约6G）： 命令如下： Subsample 20M read pairs fro...
1.从bam文件中提取未比对上的reads到新bam文件 samtools view -bf 4 IP_988_1...
若想要从sam或bam文件中提取指定区域内的reads，可以使用samtools和bedtools来实现。 首先...
1.提取人脸到aligned-images目录（姿势检测和校准） ./util/align-dlib.py ./t...
将带参数的url地址中的参数提取组合成对象 const getUrlParams = (search) => { ...
每条reads长度为150bp，通过换算将原始数据缩减，然后质控到6G左右。其中seqtk截取数据，head等提取...
话休絮烦 主要流程： 将reads比对到基因组上； 将比对好的reads进行拼装； 量化基因的表达水平； 计算在不...
Reads：高通量测序平台产生的序列就称为reads。 Contig：拼接软件基于reads之间的overlap区...
本文标题：2019-06-15 提取align后不成对的reads
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/bvxbfctx.html
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