基因家族鉴定--motif分析

1.用到了MEME在线网站MEME - Submission form (meme-suite.org)，参数什么的不用改，数量改成20（10也可以，最好多一点），填个邮箱毕竟还要等一会儿。

meme

2.数据出来了

两个方法做的，一个meme一个mast，深层的东西搞不清楚，是这样的吧。我们把meme的保存起来。直接复制粘贴就行了。

xml文件很长，打开是这样，第一句话意思：This XML file does not appear to have any style information associated with it. The document tree is shown below.此XML文件似乎没有任何与之关联的样式信息。文档树如下所示。

不重要，继续！

3.可视化

用tbtools，没办法水平不够，这个gene structure view的插件很好用，自带的。

需要进化树，xml文件，对应基因的gff（不要也能出图），另外一个重命名。中间两个还没研究，下次再写。

路劲里最好不要带中文。

出问题了，xml里面的第一句话不能要，删掉，出来了，但是很奇怪。