跑cellphonedb遇到的问题

在运行cellphonedb的时候遇到这句

karate_groups <- cluster_optimal(net) #统计每个端点的和

报错具体原因是这个函数cluster_optimal是在igraph这个包里面要用到GLPK好像是这个，然后它自从igraph包1.2.1以后就被移除了，所以要自己安这个，但是我也试过了，linux安装需要用到sudo，如果你不是root用户，还是不要安装了，

直接换个思路就是安装igraph小于1.2.1版本的就行,下载的时候直接进入r的cran，直接搜这个igraph，然后打开以后找到以往的版本，就可以下载到1.2.1以前的了，这时候要注意我是已经安装了igraph以后又安装了低版本的，好像不太行，需要卸掉以前下载的igraph，要是和我一样不知道怎么卸载版本问题的话，很简单就直接把所有的igraph都卸载了，然后重新install安装，这是偶要注意直接library是不会成功的，需要重新启动r，这样就可以正常运行了！

关于cellphonedb有很多的帖子大家可以自己去搜一下，写的都很好的。