cellphonedb安装

昨天搞了一天，奋战到10点多。终于搞定cellphonedb的安装，说说我的心得。

先说说安装步骤，看似很简单，其实很心酸

conda create -n cpdb python=3.6

source activate PAth/cpdb

pip install cellphonedb ####这一步一定会报错，可以参考下面几点解决

1.如果发现pip下载慢，建议指定国内的镜像安装，如下

 pip install-i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple cellphonedb

2.提前安装几个包

pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple h5py

pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple  numpy

这里建议python使用3.6版本的，版本太高总会在 h5py，numpy出错。

3. 可能会出现pip uninstall certifi 的问题，手动删除python3.6/site-packages/下的certifi的所有文件

find PAth/cpdb/lib/python3.6/site-packages/  -name *certifi*