82.《Bioinformatics Data Skills》之

上节我们采用SELECT直接进行列信息提取，实际上可以在提取的同时创建与命名新的列。

以一个例子说明：

sqlite> SELECT lower(trait) AS trait,
   ...> "chr" || chrom || ":" || position AS region
   ...> FROM gwascat LIMIT 5;
trait                 region
--------------------  --------------
asthma and hay fever  chr6:32658824
asthma and hay fever  chr4:38798089
asthma and hay fever  chr5:111131801
asthma and hay fever  chr2:102350089
asthma and hay fever  chr17:39966427

其中第一句将trait列转为小写并命名为相同的名字trait；第二列通过||串连字符，创建“chr6:32658824”格式的输出并命名为region。

当某列信息存在NULL时，可以转为NA值，方便下游工具（如R）分析：

sqlite> SELECT ifnull(chrom, "NA") AS chrom , ifnull(position, "NA") AS position, strongest_risk_snp FROM gwascat WHERE strongest_risk_snp == "rs429358";
chrom  position  strongest_risk_snp
-----  --------  ------------------
19     44908684  rs429358
19     44908684  rs429358
NA     NA        rs429358

以上内容仅是皮毛作为例子，其它常用的SQLite函数包括：

SQLite 常用函数 SQLite 常用函数