1.思维导图

DAY7-初涉测序.png

2. 一代测序

sanger法测序（“双脱氧终止反应法”，观看）：顾名思义，DNA在聚合酶的作用下进行无数次合成，每次到了ddNTP就终止，这样就得到不同长度的序列，每个序列的末端就是带有荧光标识的ddNTP，这样每次只测一个ddNTP，就能反推到序列了。
需要以下材料

1. DNA模板
2. 只有5‘端的带荧光的dNTP 即ddNTP
3. 引物（打开反应的钥匙，并起到在特定的点开始聚合）
4. DNA聚合酶
5. 4种dNTP

3. 二代测序（Illumina公司：边合成边测序）

需要：
DNA文库：把基因组DNA打断，然后再许多的DNA片段两头加上了接头。（接头序列已知，但中间插入的DNA片段序列未知）
flowcell ：8条通道，并做了化学修饰（两种DNA引物种在上面，引物和DNA文库的接头（adapter）序列互补），当DNA液体流过flowcell时，接头和引物配对的序列不会被冲走。
桥式PCR：将文库种到flowcell上，并进行扩增
测序：和一代测序类似，（但是一个循环后，会使用酶将3’端的羟基暴露出来）
index：在adapter里面（还需要进一步体会）

4. 三代测序

PacBio公司的SMRT和Oxford Nanopore Technologies 的纳米孔单分子测序技术为代表 （不懂0.0）

5. 专有名词

基因组学（即核酸的序列分析）
全基因组
全外显子组
简化基因组
转录组（基因表达分析）
mRNA-seq
。。。
蛋白组学
代谢组学

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一周的学习完成，感谢小花花和小豆豆老师！OVER~