解析本题主要考查居民纳税人与非居民纳税人、纳税申报。
根据《企业所得税法》第2条规定，企业分为居民企业和非居民企业。本法所称居民企业，是指依法在中国境内成立，或者依照外国（地区）法律成立但实际管理机构在中国境内的企业。本法所称非居民企业，是指依照外国（地区）法律成立且实际管理机构不在中国境内，但在中国境内设立机构、场所的，或者在中国境内未设立机构、场所，但有来源于中国境内所得的企业。
由此可知，A基金依照外国法律成立且实际管理机构不在中国境内，属于非居民企业，故A项正确。
D企业依照中国法律在中国境内成立，属于居民企业，故B项正确。
根据《企业所得税法》第3条规定，居民企业应当就其来源于中国境内、境外的所得缴纳企业所得税。非居民企业在中国境内设立机构、场所的，应当就其所设机构、场所取得的来源于中国境内的所得，以及发生在中国境外但与其所设机构、场所有实际联系的所得，缴纳企业所得税。非居民企业在中国境内未设立机构、场所的，或者虽设立机构、场所但取得的所得与其所设机构、场所没有实际联系的，应当就其来源于中国境内的所得缴纳企业所得税。
根据上述分析，A基金属于非居民企业，在中国境内未设立机构、场所，但有来源于中国境内的所得，应当就其来源于中国境内的所得缴纳企业所得税，故C项正确。
《企业所得税法》第41条规定，企业与其关联方之间的业务往来，不符合独立交易原则而减少企业或者其关联方应纳税收入或者所得额的，税务机关有权按照合理方法调整。
企业与其关联方共同开发、受让无形资产，或者共同提供、接受劳务发生的成本，在计算应纳税所得额时应当按照独立交易原则进行分摊。
《企业所得税法》第44条规定，企业不提供与其关联方之间业务往来资料，或者提供虚假、不完整资料，未能真实反映其关联业务往来情况的，税务机关有权依法核定其应纳税所得额。
《企业所得税法》第47条规定，企业实施其他不具有合理商业目的的安排而减少其应纳税收入或者所得额的，税务机关有权按照合理方法调整。
以上三个法条均规定了特别纳税调整的情况，在满足条件的情况下，税务机关有权对企业的应纳税收入进行调整，故D项正确。
综上，本题答案为A、B、C、D。
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