如何用Origin绘制分边小提琴图

Origin是一个更新得比较及时的软件，之前需要一些“巧思”才能完成的作图，在新版本往往会有优化。比如我在《双坐标轴组合图的画法》中介绍用17版绘制双Y轴柱状图是需要引入“空位”避免柱子重叠，而在18版就出了专门的绘制工具；再比如我在《如何用Origin绘制热图？》用18版给热图添加数据要在热图上添加散点才能实现，而在2019中只需“打个勾”显示数据就可以完成了，如下图。

正式版的Origin 2019最近刚推出，除了对之前的功能进行了优化之外又增加了很多新功能，比如这次加入了多种小提琴图的绘制。

由于OmicShare课堂推出的Origin教程用的是2018版，接下来我会结合读者反馈在原来的基础上追加一些新内容，比如用2019版如何快速绘制相关性热图、小提琴图等，并对误差线、图例、颜色的调整做专题详解。

言归正传，常规小提琴图的绘制大家可以用OmicShare的小提琴图和分组小提琴图工具（http://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/getsoft），当然你也可用R、Python绘制。

分边小提琴图（Split violin plot）类似于分组小提琴图，但更便于进行两两（类似白天黑夜、雄性雌性、表面内部等）比较，如下图，目前貌似Python的Seaborn包可以画，也有高手用ggplot2画。今天主要给大家介绍Origin 2019绘制分边小提琴图。

（Piper B, Barham R, Sheridan S, et al. ，2017） （Nature communications, 2017）

数据准备

数据与普通小提琴图、箱型图的相类似，只不过添加一列分组数据将整个数据集分为“两段”，如下图，为了方便观察这里给表格填充了底色。

图表绘制

选择作图数据的方法有两种，这里介绍最快最省事的一种方法。类似Excel的操作，将鼠标指针悬停在表格列名上然后选中5列数据（包括分组数据），如下。至于另一种方法，图例需要自定义设置，比较复杂一点，我将在视频中介绍。

然后进入Plot菜单下Violin Plot。

点击一下Split Violin即可完成绘制，初始结果如下：

图表美化

你可以再添加其余的坐标轴以及移动图例的位置、更改图例边框的颜色。

不喜欢图中的线，可双击图形进入Plot Dtails窗口，将Box style由I-shaped Box 改为 No Box，你也可选 Box，调整 Box width(%) 参数实现实例的效果。

然后，在 Lines 选项下，取消 Median Line 的勾选，这样图上也没有中值线了。

在 Distribution 选项下，可选择密度函数类型（Curve Type），如这里将默认的Kernel Smooth改为Normal，图形就变得“圆滑”了。在该窗口也可改变Fill的颜色，可选择已有的配色方案，比如这里选Q05。

如果对Q05的颜色不满意，还可点右侧的“✏”，自定义颜色列表，如下图。

你也可以选中图例，右键，调整图例中的图形和文字，如下图，可将图例改成水平排列的方式。

效果如下图这样：

当然如果觉得这样的密度曲线展示的信息少，将密度函数类型（Curve Type），改回默认的Kernel Smooth， 最终的效果如下：

学会了Split violin 再学普通的小提琴图自是小菜一碟，这里放一张Origin绘制普通小提琴图与一篇NC文章的小提琴图的比较图。

最后再罗嗦一点，虽然Origin教程的视频总长度和一部大电影差不多，既然选择“投资自己”就不能像看电影一样，看过没多久就忘了。建议在看视频教程的时候先下载好附件中的工程文件，边看边操作，独立去思考和探索。

另外，双十一期间（从即日起）Origin 科研作图系列教程八折优惠（花费不及出去看场电影），大家想学Origin作图又不想把时间浪费在教程寻找上就赶紧啦~

教程链接：http://www.omicshare.com/class/home/index/series?id=40

最后，如果实验室经费充裕，完全可购买新版软件，若你有edu.cn/ac.cn结尾的邮箱也可以申请免费使用半年的学习版，详情可到论坛查看（点击 这里查看）。今天的内容就到这里啦~

参考文献

https://www.researchgate.net/publication/318724687.

Elewa A, Wang H, Talavera-López C, et al.Reading and editing the Pleurodeles waltlgenome reveals novel features of tetrapod regeneration[J]. Naturecommunications, 2017, 8(1): 2286.

Zheng, Qiupeng, et al. Circular RNA profilingreveals an abundant circHIPK3 that regulates cell growth by sponging multiplemiRNAs. Nature communications 7 (2016).

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