美文网首页生信星球培训第二期
学习小组Day5笔记--董昆

学习小组Day5笔记--董昆

作者: dongkun031 | 来源:发表于2018-08-29 11:03 被阅读13次

这部分主要是R和Rstudio的下载与上手

今天的内容,怎么说呢。。。并不难,但是各种零七八碎的内容很多,还是得梳理下,所以,上导图先,做得比较乱,将就看。。。


R和Rstudio的下载与上手

前期工作,关于电脑用户名

在下载和安装Rstudio之前,先查看你的电脑用户名是中文还是英文。。。
这很重要,因为中文用户名无法安装Rstudio。。。好吧,毕竟是老外做的软件

  • 电脑用户名是这样子查滴
    • 在电脑桌面上新建个文件夹

    • 进入文件夹,然后点击左上角的 “文件夹” 图标,显示 “C:\Users\Administrator\Desktop\新建文件夹”

    • 这样子就表明你的电脑用户名 (Administrator)还是英文的,如果Administrator位置是别的中文名字,表明你之前把用户名改成了中文。。。

    • 中文用户名请参考这里

下载R和Rstudio

  • 推荐微信搜索 “果子学生信 给自己一个全新的R语言环境”,帮助很大

  • 下载R语言

    • 选择“Download R for Windows”
    • 点击“base”
    • 选择“Download R 3.5.1 for Windows”
    • 之后就是常规的软件下载安装那一套(记得装在C盘这种软件默认C盘,装在别的地方有可能运行不了 别问我为什么
  • 下载Rstudio

    • 选择第一个 “RStudio Desktop Open Source License”,点击
      “DOWNLOAD”
    • 进入下载列表,依喜好选择下载版本(此处选择 RStudio 1.1.456 - Windows Vista/7/8/10
    • 之后就是常规的软件下载安装那一套(记得装在C盘,理由同上)
    • 安装完成后,点开Rstudio
      • 依次点开 Tools下的 Global Options
      • 在弹出界面设置 pakage(面板)appearance(外观)
        mirror这里,选择清华的服务器
        外观这里,直接用小洁的图了,很清晰

认识Rstudio:性质和工作界面

  • 性质:本质上是作为R的操作平台
  • 工作界面:一共四个(如果运行时发现少于4个,Ctrl + Alt + Shift + 0
    • 左上界面:代码窗口,打开脚本文件
      • 新建:New file — R-script 脚本文件
      • Run:运行
      • reRun:再次运行
      • source:运行脚本中所有代码
      • source with echo:显示脚本运行的详细信息
      • 荧光棒:对脚本进行检查
      • 放大镜:查找和替换
      • 保存:将代码保存在一个文件中
    • 左下界面:控制台
      • Rstudio的主要操作区
      • 交互式使用
      • 可以自动补齐
    • 右上界面
      • history:历史记录,显示敲过的代码
      • Environment:环境,显示对象及其数值
    • 右下界面:集成:文件/绘图/包/帮助
      • files:工作区的文件
      • 图形展示窗口(Plots):绘图窗口,最简单的绘图命令:plots
      • 帮助(Help)


        继续用小洁的图片,箭头帮助很大
    • 常用快捷键(还是抄小洁的)
      • 显示历史记录:在控制台输入 control+上箭头
      • 中断当前操作:ESC
      • 显示所有快捷键:alt+shift+k

用R作图

  • 这里只用最基本的plot
    输入 plot(runif(50))
    第一张图,虽说是按着教程模仿的

R的基本操作

  • 设定/查看工作目录

    • 设定工作目录:setwd(dir="D:/教程/生物信息(孙小洁)/Rdate")
      PS: 这里用应注意 “” 的使用和 / 的方向,以及用英文输入法,另外,dir=可以省略
      相当于linux的pwd(查看工作目录)
    • 查看工作目录:getwd()
  • 显示文件列表

    • list.files() 或者 dir()
    • 这俩一个意思,都相当于ls


  • 计算

    • 1+2 回车


  • 函数

    • 列出函数:
      ls() :列出变量名
      str(a):列出变量a的具体信息
      ls.str(a):列出变量名a及其具体信息
      ls(all.name=TRUE):将以.开头的对象也一并列出
    • 函数的输入:
      以“求和”为例:输入 sum(1,2,3,4,5)
  • 赋值

    • 赋值符号:<- (长得跟箭头似的)
      小于号加上减号
    • 含义:x<- 1+2
      意思是把1+2的运算结果赋值给x,赋值后,x会显示在右上角的框,Environment里的Value列表里
      直接输入x,然后回车,出现3,[1]是个行号,3就是x的值

    • 延伸:y<- sum(1,2,3,4,5)
      意思是把1+2+3+4+5的运算结果赋值给y
    • 其它:->,意为把左边赋值给右边(不太常用)
  • 删除对象

    • rm(b):删除 b
    • rm(u,c):删除 u 和 c
  • 列出历史记录

    • history():会给你列出一大堆
    • history(10):列出最近的10条记录
  • 清空屏幕

    • ctrl+l
  • 保存工作空间

    • save.image:保存数据和绘图函数

今天就这样吧,明天继续

相关文章

  • 学习小组Day5笔记--董昆

    这部分主要是R和Rstudio的下载与上手 今天的内容,怎么说呢。。。并不难,但是各种零七八碎的内容很多,还是得梳...

  • 学习小组Day4笔记--董昆

    主要是学习、了解测序相关知识 测序的发展历程和区分 二代测序原理(这个比较深,很多地方没看懂) 主要就是这些了,另...

  • 学习小组Day2笔记--董昆

    召唤Linux Linux 本质上是个操作系统,和Windows,Mac性质一样 操作靠键盘输入命令行来实现 我们...

  • 学习小组Day3笔记--董昆

    Linux环境下的软件安装 开始前的准备工作 bzip2 的检测及安装 bzip2 是一个压缩命令,相当于压缩软件...

  • 学习小组Day6笔记--董昆

    这一部分主要介绍了数据类型和数据读取 先上导图 数据部分主要介绍了向量、数据框 向量 标量和向量的区分标量:一个元...

  • 学习小组Day5笔记-柏金bbj

    [学习小组Day5笔记-柏金bbj] 鼓捣了一晚上的成就,就用这个来补上d4的作业把~

  • 学习小组Day5笔记--kan

    笔记来自生信星球学习小组资料 Day5 学习内容-R语言数据类型 1.思维导图镇楼 2.R语言数据类型 向量 ve...

  • 2020-06-19

    学习小组Day5笔记--马小林 1、新手指南 (1)向量是由元素组成的,元素可以是数字或者字符串。(2)表格在R语...

  • 学习小组day5 笔记(丹)

    时间不足,只能上传思维导图了

  • 学习小组Day5笔记

    小知识点 (1)在Console 控制台输入命令,相当于Linux的命令行(2)R的代码都是带括号的,括号必须是英...

网友评论

    本文标题:学习小组Day5笔记--董昆

    本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/cyqhwftx.html