问题来源

好久没升级R版本了，今天升级后安装Bioconductor相关R包的时候出现Error: Bioconductor version '3.8' requires R version '3.5'; see https://bioconductor.org/install的报错

library(BiocManager)
BiocManager::install("edgeR")
Error: Bioconductor version '3.8' requires R version '3.5'; see https://bioconductor.org/install

解决思路

明显就是升级了R但是BiocManger还没跟上脚步，因为我们在升级R语言的时候，library是没有变动的，导致我的包都是3.5版本的，所以解决问题第一时间想到的就是更新BiocManager到3.9（当然还有一种思路，在Options里面将R的版本重新选择3.5.3的，也能解决问题，我们都升级R了，当然是希望重新配置下所有R包的，所以这种方法就不介绍了，不过也可以当作以后解决类似问题的一种思路）

BiocManager::install(version = "3.9") #出现Upgrade 56 packages to Bioconductor version '3.9'? [y/n]:   输入y就好了，此次更新56个包
# 升级完了之后再次运行
BiocManager::install("edgeR")
# Bioconductor version 3.9 (BiocManager 1.30.4), R 3.6.0 (2019-04-26)
# Installing package(s) 'edgeR'
# also installing the dependency ‘locfit’   
# package ‘edgeR’ successfully unpacked and MD5 sums checked

搞定！

作者：解琪琪
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来源：简书
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