###分析测序原始reads的GC含量的必要性
二代测序平台存在一定的偏好性,通过分析原始测序reads的GC含量与物种基因组的GC含量的偏差,能够判断测序过程是否足够随机,平台是否存在较大的测序偏差。比如人类的基因组GC含量大约为40%,如果测序原始数据的GC含量远远偏离这个比例,说明测序数据存在一定偏好性,如果直接用测序数据,会影响后续的CNV和变异检测的分析。
###分析测序原始reads的GC含量的必要性
二代测序平台存在一定的偏好性,通过分析原始测序reads的GC含量与物种基因组的GC含量的偏差,能够判断测序过程是否足够随机,平台是否存在较大的测序偏差。比如人类的基因组GC含量大约为40%,如果测序原始数据的GC含量远远偏离这个比例,说明测序数据存在一定偏好性,如果直接用测序数据,会影响后续的CNV和变异检测的分析。
本文标题:GC含量的偏好性
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