③📚[目录]哈医数据库③LncMAP、LNCat

1.哈医数据库①Lnc2Cancer、Lnc2Meth、LncACTdb、MSDD
2.哈医数据库②miRSponge、Co-LncRNA、FACER

• 8.LncMAP

  • LncMAP简介

  • 长链非编码rna介导的转录网络扰动的泛癌图谱
    数据库为用户提供了一个友好的下载界面，包括the information of lncRNA-TF-gene triplets, the information of drug-lncRNA, the information of survival analysis and the regulation information of TF-gene. 用户可以根据需要下载相应的数据。该研究提供了一个系统层面的对lncrna介导的癌症调控干扰的剖析，也为研究lncrna在癌症中的作用提供了一个有价值的工具和资源，促进了lncrna相关的生物学发现和治疗干预。网站document也详细的介绍了网站的用法。
    

    LncMap

• 相关文献：

  • LncMAP: Pan-cancer atlas of long noncoding RNA-mediated transcriptional network perturbations.

简书上也有用户对lnmap做了简单的介绍 https://www.jianshu.com/p/29fae074359c
其他资料
LncMAP:lncRNA-TF-gene调控网络数据库

• 9.LNCat
  • LNCat简介

  • LNCat是一个综合性的数据库资源，它存储了目前可用的24个lncRNA注释资源的信息，为每个资源提供lncRNA结构的基因组浏览器，并从多个角度对这些资源之间的综合比对分析结果进行可视化。LNCat支持对不同lncRNA注释资源的快速探索、比较和整合，使研究者能够在感兴趣的区域内实现对lncRNA的精细注释。
    lncat提供以下服务：
    * >（1）基因组浏览器。LNCat provides the Browser portal to browse从13个lncrna注释资源浏览lncrna结构，通过基因名、ID或基因组坐标搜索lncrna，实现所有外显子结构的可视化，从而有助于发现这些注释资源中常见（或独特）的外显子结构。
    * >（2）可视化。可视化门户网站从多个角度展示了不同资源之间的比较分析结果，包括基因组信息（外显子数、基因长度、基因组覆盖率、lncRNas分类、基因组距离、保存和重复元素）、表达、组织特异性、染色质特征和功能。用户可以检查和比较这些lncrna注释。
    * >（3）下载。lncat允许用户在任何注释级别（包括基因级别、转录级别和区域级别）下载每个资源的所有lncrna注释（如果可用）。它还允许用户灵活选择感兴趣的资源，然后以联合或交叉的方式进行资源集成。

    
    LNCat

• 相关文献
  • A comprehensive overview of lncRNA annotation resources.

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