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⒂📚[目录]哈医数据库⑥-①③小结LnChrom、Ubetis-

⒂📚[目录]哈医数据库⑥-①③小结LnChrom、Ubetis-

作者: 郑宝童 | 来源:发表于2019-07-03 14:40 被阅读0次
    1. 哈医数据库①Lnc2Cancer、Lnc2Meth、LncACTdb、MSDD
    2. 哈医数据库②miRSponge、Co-LncRNA、FACER
    3. 哈医数据库③LncMAP、LNCat
    4. 哈医数据库④CellMarker、GPA
    5. 哈医数据库⑤TIP、SEECancer
    1. 哈医数据库⑥LnChrom、DiseaseEnhancer
    2. 哈医数据库⑦miRNA targets、NSDNA
    3. 哈医数据库⑧Ubetis-LncDB、LincSNP
    4. 哈医大数据库⑨LncRNA Ontology、BioM2MetDisease
    5. 哈医大数据库⑩CRADIO-LNCRNAS、IndividualizedPath
    6. 哈医数据库①①cardio_ncrna、lncSubpathway
    7. 哈医数据库①②HCOC
    8. 哈医数据①③FAM、CHG、medic、ncRi、LncMad、MetpriCNet、ncdr

    lncrna

    [LnChrom:] lncrna-chromtain互作数据库
    [Ubetis-LncDB:]组织特异性lncRNA数据库
    [LincSNP:]旨在专门存储和注释疾病表型相关变异,“以SNP位点为桥梁,建立起了lncRNA与疾病之间的关联”--by 庐州月光
    [LncRNA Ontology:]LncRNA Ontology旨在根据染色质状态和表达模式推断lncRNA的功能。
    [CRADIO-LNCRNAS:]多个组织的角度对lncrna在人类心血管系统中的作用进行了全面性的研究
    [LncSubpathway:]长的非编码RNA(lncRNA)通过介导其特定的生物通路在各种生物过程和疾病的发展中发挥重要作用。** LncSubpathway **系统通过整合匹配的lncRNA-mRNA表达谱和通路拓扑结构,提供灵活的平台来探索lncRNA的功能作用。 ** LncSubpathway 通过同时考虑lncRNA和PCG的失调以及相互作用的相关变化,确定与风险lncRNA相关并且与研究条件相关的最相关通路区域。 LncSubpathway 提供了一个分析平台,用于识别与风险lncRNA相关的子通路区域的转录失调。 此外,LncSubpathway **系统提供了两种可视化子通路的灵活方式。


    other

    [DiseaseEnhancer:]人类疾病相关的增强子资源
    [miRNA targets:]神经系统疾病相关的(实验支持的)ncRNA数据库
    [NSDNA:The Nervous System Disease NcRNAome Atlas:]是一个手动管理的数据库,提供全面的神经系统疾病(NSD)和ncRNA之间的实验支持关联。
    [BioM2MetDisease:]BioM2MetDisease数据库存储了microRNA,代谢物,小分子和代谢疾病之间的关联
    [IndividualizedPath:]通过结合DNA拷贝数,基因表达数据和生物通路的拓扑结构,从个体的角度识别遗传改变及其下游风险通路
    [Cardio_ncRNA:]Cardio_ncRNA 旨在为科学界提供有效浏览ncRNA与心血管疾病之间关联的资源。
    [HCOC:]HCOC(Hallmark associated Cooperation under specific genetic Context) 是一个综合框架,用于识别癌症进展期间的体细胞共发生事件。 它整合了来自遗传改变,基因表达和癌症标志通路信息的数据。

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