写在前面
《-零命令行-生信下游数据分析》的第四帖主题，定为韦恩图绘制
总的来说，凡是相对不简单的分析，无论是否涉及到组学数据，韦恩图（Venn）都是常见的操作之一。
目前关于韦恩图绘制，有不少推文，但可能没有一个推文提出一个绝对简单的，适合所有人的解法
一图胜千言
为了避免推文没人看，想想还是先祭出TBtools的UpsetPlot的图。Upset Plot应该算是要革了多集合韦恩图的命的一个图形展示方式。首先我们摆一张TBtools六组的韦恩图
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恩，看着有点懵逼，不过Venn Plot无需解释，再摆一张TBtools的Upset Plot
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稍微解说下图片。图形主要是三个区块：
- 图形左边的 水平柱形图，每一个柱子对应了一个输入列表，柱子长度对应的是 输入的那个列表的ID个数
- 图形下边（的右侧），标识的是当前竖直柱形图柱子对应的是哪些列表的交集，如第一个（最长的）那个柱子，其中只有一个黑色圈圈，所以上边竖直柱形图对应的柱子 571 即标识 Set3 具有唯一的 571 个ID；类似的，图中已经被我调整为蓝色的“圈圈-连线-圈圈”，标识的是，Set1 和 Set3 和 Set4 和 Set5 独有的交集；而图中已经被我调整为绿色的“圈圈-连线-圈圈”，标识的是，Set1,2,3,4,5 独有的交集。总的来说，对比Venn Plot应该就什么都知道啦
- 图形上边的柱形图..... 相信无需解释了
好的，下面进入正文。
韦恩图绘制的相关解法与局限
解法：
- 网页工具，如Venny
- 界面化工具，如......
- R语言包
局限：
- 网页工具，数据的复制黏贴是个问题。这个主要可能受到网速的限制
- 界面化工具是不错的解法，然而目前看来操作并不够简单，各种麻烦，而且基本就真的只能画Venn
- R语言包；总的来说，相对优秀的R语言使用者都会贡献出一些不错的R包，似乎R语言除了不能帮你生孩子之外，没有什么做不到的了....。But，首先，编程！。其次，数据整理麻烦！一旦超过5组的Venn，就要Upset了。而一旦要用UpsetR，又有一堆人要懵逼。原因是UpsetR需要输入所谓的0-1矩阵。
没人愿意整，那就让我来
大背景是，TBtools早就支持二到六组的Venn，而且还有一些独特的优点：
- 本地化，你需要做的就是拖文件进去，或者复制ID列表进去，然后点击Start
- 可以随意使用取色器，任意修改颜色，甚至是修改形状，线条粗细等
- 可交互，所有数字标签，双击可以获得列表；所有元件，包括标签位置可以随便拖动
- 可以导出300dpi图片或者矢量图如PDF svg
- 批量输出交集和差集列表
操作方式简单
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-
黏贴ID列表或拖文件（有多少个列表就拖多少个列表）
-
点击Start
摆一些例图
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但是，以上远远不够
任何韦恩图绘制，只要超过4组，其实都比较丑。所以只有UpsetPlot才是解法。
你需要做的事情很简单，几乎可以在几秒钟之内完成：
- 打开TBtools
- 移动鼠标，点击六次"Add"（因为一共是有6个列表要看差集和交集），你有多少个列表就点击多少下
- 分别把每个列表拖进去或者黏贴进去
- 点击“Never be Upset!”即可。
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图形是可以交互的，双击 竖直柱形图的对应柱子，即可获得对应的ID列表。出图使用的TBtools最近的JIGplot绘图引擎，所以...拥有先天出图和交互优势。
写在最后
....讲真的，写到这里我不是太想写。GUI工具，写一个介绍，真的有点虐。
不如录一个小视频来的简单。OK，感兴趣的朋友
欢迎加入TBtools使用交流群 讨论TBtools的使用，
软件，我放在群共享了，去拿吧
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