1.标量和向量的区分

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标量：一个元素组成的变量
向量：多个元素组成的变量

x<- c(1,2,3)#常用的向量写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。
x

x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数
x

x<- seq(1,10,by = 0.5)#1-10之间每隔0.5取一个数（注意是逗号不是分号）
x

x<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次
x

2.从向量中提取元素

（1）根据元素位置

x[4] #x第4个元素

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x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素

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x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
（2）根据值

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x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素

数据结构

（1）读取本地数据

X<-read.csv('doudou.txt')

image.png

read.table(file = "huahua.txt",sep ="\t",header =T)
a<-read.table(file ="huahua.txt",sep ="\t",header = T)

image.png

（2）设置行名和列名

X<-read.csv('doudou.txt')#在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框

colnames(X)#查看列名

rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...

colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改

image.png

X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名

file.choose()：读入该文件，这样我们知道该文件的具体路径。
file参数： 路径和文件名，windows下用的是反斜杠\
head=T： 是首行问题，T表明文件有标题，将文件中的第一行作为列名。若head=F,则原来文件没有 标题，增加一行V1,V2，...作为文件的第一行，即作为列名。read.csv()函数默认为head=T。

sep=“,”： 分隔符问题，这里分隔符的选择会影响输入的被引用的字符串。

nrows=200： 行数问题，表明读取该文件的前200行。

stringsAsFactors = FALSE : 字符型数据读入时自动转换为因子，防止转换为因子，令参数stringsAsFactors = FALSE， 防止导入的数据任何因子的转换。

（3）数据框的导出

write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号）

（4）变量的保存与重新加载

save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(x,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令

（5）提取元素

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（6）【选修部分】直接使用数据框中的变量

options(stringsAsFactors = T)
a <-data.frame(case=paste0("S",1:9),values=runif(9))
plot(a$case,a$values)

环境设置函数为options()，用options()命令可以设置一些环境变量
stringsAsFactors = FALSE : 字符型数据读入时自动转换为因子，防止转换为因子，ringsAsFactors = FALSE， 防止导入的数据任何因子的转换。

data.frame()的使用

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所以case=paste0("S",1:9)相当于横坐标的取值,values=runif(9)相当于纵坐标的取值

方法1：attach

将数据框名添加到搜索环境中：attach（a）,作图时就只需输入列名(连$都不用了)。
attach(a)
plot(case,values)

问题：

Q:save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found，是为什么，应该怎么解决？
A:X应该是小写