从针灸腧穴学的分类法来考究“阿是穴“，它应当是人体十四经穴的萌芽阶段。那么，阿是穴的由来究竟起源于何时呢？这还得从古石器时代说起，相传，那时有一户庄稼人和一户猎人为邻居，他们种田打猎相依为生，一次，猎人腿痛，在家躺了几天仍不见好转，只得咬牙外出。当他上山时，一不小心把石头登翻了，摔倒在地，恰巧把小腿外侧摔伤流了些血，可是出乎意料，腿竟然一点也不痛了。他轻松地上山去，这一日比往常猎取的野兔、山鸡更多。时隔不久，邻居种田人也患腿痛病，卧床不起。猜人去看望，并告诉他，自已上次腿痛是摔在石头上才好的。种田人听后甚喜，求猎人扶他到那块石头处，放意摔了一下小腿外侧，腿痛竟然也减轻大半，从此渐渐而愈。
后来，聪明的劳动人民磨尖石块，拿着它往病痛处碰，同样起到“石到病除”的效果。当时人们不称为“穴位”，而笼统地称作“砭灸处”。最早的穴位无准确定位，也无名称，凡是痛点就可施灸或用砭石刺之，也就是“以痛为输”。“输”同“腧”，有转输之意。脏腑经络之气输注于体表的部位即是穴位。
确切地说，阿是穴首见于《灵枢·经筋》“以痛为输”；次见于《千金要方》，称“天应穴”和“不定穴”。唐朝更有文献记载，“阿”即指“痛”而言，“阿是”也就是“痛是”，就是人体的体表压痛点。
唐朝，有位猎人请孙思邈给治疗腰腿痛。由于猎人距家遥远，就留在孙医生家中观察。光阴荏苒，半月过去了，孙医生针药并施，但猎人的腰腿痛依然不见好转。他全神贯注地在猎人疼痛的腿上按压、寻找，突然患者皱着眉头喊“啊！疼、疼……”“这里最疼吗？”孙思邈问道。“是，是。”猎人答道。这时，孙医生胸有成竹地拿过一根银针，迅速地往猎人腿上的痛点刺了进去，并施用了捻转手法。起针后，患者的腰腿痛竟然减轻八成，次日又继续针刺一次，猎人完全康复。孙思邈对全身已有的腧穴是十分精通的，可是这个穴确实没有记载。他思索了很久很久，忽然高兴地说：“就叫阿是穴吧！”从此，在祖国的针灸医学里，又增添了一朵奇葩—阿是穴。
孙思邈对阿是穴颇为重视，在他的名著《备急千金要方》第29卷里写着：人有病痛，即令捏其上，若里当其处，不问孔穴，即得便快或痛，即云‘阿是’，灸刺皆验。”可见，阿是穴就是压痛点。它是穴位的起源，是各类穴位发展的最初阶段。在临床上，有时按压到敏感的地方既不是“经穴”，又不是“经外奇穴”，那就可以称为阿是穴。
阿是穴在临床的应用，多以治疗经筋患病或局部气血失调而发生的疼痛病。
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