gffread -E --keep-genes input.gtf -o input/output.gtf
我的gtf注释文件如上 我想要的如下 参考链接 https://www.biostars.org/p/224372...
目标: 根据下载的GTF文件,利用bedtools提取基因组的不同区域。 实例: 见参考的网站 参考: 1、htt...
即使原gff文件中没有exon的信息,可以用 脚本 | Shell | 提取每个转录本exon坐标[https:/...
Cufflinks程序主要根据Tophat的比对结果,依托或不依托于参考基因组的GTF注释文件,计算出(各个gen...
GFF文件与GFF文件来源 1.1 GFF文件来源 1.1 GTF文件来源 GFF文件与GTF文件格式 2.1 ...
基因组注释文件GTF/GFF格式的介绍 GFF 2 -> GTF -> GFF 3 The GTF ...
● src: android 源文件,与java EE中的一样● gen: gen中有两个文件,一个BuildC...
将 gff 文件转成 gtf (featurecounts需要使用gtf文件) 构建参考基因组的索引文件 hisa...
GFF和GTF是两种最常用的基因组注释格式,在信息分析中建库时除了需要fasta文件一般还会需要这两种文件,提取需...
1. 对gtf文件进行处理: cat GSE52313_transcripts.gtf | grep "gene_...
本文标题:2023-02-16 gtf文件中如果只有exon,想增加gen
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