可以利用amber的cpptraj 转换成gromacs trr文件
cpptraj -p myparm.parm7 -y x.mdcrd -x x.trr
可以利用amber的cpptraj 转换成gromacs trr文件 cpptraj -p myparm.parm...
如果在运行分子动力学的时候,轨迹文件的步长设置的太短,或者输出文件输出的太频繁,这样会导致生成的nc文件非常大,此...
1 压缩gromacs的trr轨迹文件 #因为trr格式的轨迹文件包含轨迹 坐标x, 速度v和力f的信息(二进制,...
将prmtop和dcd轨迹导入vmd中,随后用vmd生成每一帧的PDB文件 pbc wrap -centersel...
每个人的人生,都有不同的轨迹,就像地球总是绕着太阳转,七大行星也是绕着太阳转。每个行星都有自己的轨迹,这个轨迹在人...
参考链接 轨迹聚类算法分为三步骤: 轨迹特征点提取,轨迹划分 轨迹聚类 分段轨迹聚合 1:原始轨迹划分 划分原则:...
18.2.28宝宝会拍手了,说鼓掌就知道拍拍小手。听着音乐身子还一扭一扭的跳舞,或者是挥着两只小手。哈哈,小可爱,...
上班,已经步入正常轨道,而我,也回到了原来的轨迹! 可是,想想却觉得有点累。 一直说要做减法,可是我却什么都没减下...
行夜如影 灯盏成行 远散近聚 遵循道路的信条 追赶方向的箭羽 黑夜白昼心海的天空 无风、无雨 一座孤岛、一棵椰树、...
1, 朝云暮卷,风雨欲来,零星工蚁夹杂在成群兵蚁之中,按部就班地进行小规模地修缮迁移。忽而碎石滚落,叶涌沙随,蚂蚁...
本文标题:AMBER轨迹转换为GROMACS轨迹
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