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外泌体多组学16-颅内动脉瘤患者血浆外泌体中miRNA有效数据量

外泌体多组学16-颅内动脉瘤患者血浆外泌体中miRNA有效数据量

作者: 信你个鬼 | 来源:发表于2022-05-18 23:58 被阅读0次

外泌体衍生的microRNAs(miRNAs)是潜在的诊断性生物标志物。然而,关于它们作为颅内动脉瘤(IAs)的诊断生物标志物的有效性,我们知之甚少。本研究旨在探讨IA患者血浆外泌体中miRNA的水平,以确定预测IA发生和进展的潜在生物标志物。

文章信息

  • 文献标题:Exosome-Derived MiRNAs as Biomarkers of the Development and Progression of Intracranial Aneurysms
  • Doi:http://doi.org/10.5551/jat.51102
  • 发表时间:J Atheroscler Thromb, 2020
  • 通讯作者:Chao Qin 广西医科大学附属第一附属医院神经内科

数据情况

12 IA patients (4 UA and 8 RA) and 4 HC

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数据量

小RNA测序中,每个样本约20.3±4.30M个raw reads(表4);过滤接头之后:平均每个样本月9.3±4.0M clean reads

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比对率

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总共检测到2590 miRNAs,过滤之后:miRNAs with less than 10 RPKM in less than 50% samples were removed, leaving 539 miRNAs。

小结:

  • 原始数据,比对率,过滤情况

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