具体过程见下图
计算基因丰度.jpg
参考
A metagenome-wide association study of gut microbiota in type 2 diabetes
背景： 将测序得到的细菌基因组数据上传NCBI前，需要计算基因组覆盖度,而这个可以根据基因组测序报告来进行计算 1...
具体过程见下图 参考 A metagenome-wide association study of gut mic...
HUMAnN2是由Huttenhower组发布的，基于全基因组测序数据用于计算基因丰度的软件。本节我们要用其对PI...
介绍 GenomeScope 可以从未组装的测序数据推断基因组的全局特性，包括基因组大小、重复元件丰度和杂合率。G...
本文使用某宏基因组测序数据中的种水平类群丰度表，并直接根据所有种相对丰度总和，提取出top10丰度的种类群，作图展...
基因组重测序数据目的：需要检测基因组中的变异，找到并定位这些突变位点 条件：参考基因组、重测序数据、 分析流程： ...
什么是测序深度和测序覆盖度 测序深度（depth）是指测序得到的总碱基数与待测基因组大小的比值，可以理解为基因组中...
主要内容： 1.16S rDNA测序 2.宏基因组测序 3.宏基因组的由来及发展过程 4.16S rDNA测序与宏...
1 测序方法分类 2 基因组测序 2.1 全基因组测序 大型全基因组测序对人类、植物或动物基因组等大型基因组（＞5...
基因组重测序是挖掘候选基因的重要手段，转录组测序则是研究基因表达量差异的主要方法。通过基因组重测序中的全基因组关联...
本文标题：宏基因组meta测序数据中基因丰度的计算
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