1.conda介绍

conda就是类似于一个软件商店

conda软件介绍-来源于生信小白第3天-linux的App Store

2.下载 安装 激活miniconda

进入清华镜像https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/
找到适合自己电脑的版本，我一开始拖到最底下选择了Mac。。。实际上应该是选Linux版本的。

下载miniconda的命令是：
wege 下载链接
安装miniconda的命令是：
bash 装的版本
激活miniconda的命令是
source ~/.bashrc

3. 添加镜像

# 使用清华镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes

不知道是什么原因，我添加这个镜像好像是已存在，不知道是不是安装了两遍

4.使用conda

conda list 是查看所有安装的软件列表
conda search fastqc 搜索软件名
conda install fastqc -y 安装这个软件，-y相当于yes
conda remove fastqc -y 卸载这个软件

5.配置多个环境

查看当前conda存在哪些环境

conda info --envs

建立一个名叫rnaseq的conda环境，然后指定python版本是3，安装软件fastqc、trimmomatic

conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
原来这个-n是命名的意思

激活新环境

conda activate rna-seq

退出当前环境

conda deactivate