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shinyGEO分析GEO数据

shinyGEO分析GEO数据

作者: 没有猫但是有猫饼 | 来源:发表于2020-06-03 10:26 被阅读0次

    参考这篇

    install.packages(c("shiny","survival","shinyBS","GGally","ggplot2","shinyAce","knitr","rmarkdown","RCurl","shinyjs","shinydashboard", "survMisc"))
    install.packages('devtools')
    devtools::install_github('rstudio/DT', ref = "f3e86a6")
    
    表示安装好了
    source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
    biocLite(c("Biobase","GEOquery"))
    

    但是参考文章里这两句语句↑在R升级后已经不能这么写了,改为↓

    BiocManager::install("Biobase")
    BiocManager::install("GEOquery")
    

    然后运行

    library(shiny)
    runUrl("https://github.com/gdancik/shinyGEO/archive/master.zip")
    

    但是我运行后一直在loading,遂放弃😶


    所以我还是选择了网页版,时好时坏吧

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