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[R代码]单细胞数据画小提琴图

[R代码]单细胞数据画小提琴图

作者: expgene | 来源:发表于2023-11-02 23:12 被阅读0次

    探序基因肿瘤研究院 整理

    参考:

    知乎-scRNA分析| Seurat堆叠小提琴图不满足? 那就ggplot2 堆叠 各种元素

    代码:

    1.

    VlnPlot(Seurat, features = c("CD4","CD8A","CD8B"),

            stack = TRUE,

            sort = TRUE,

            cols = c("red","blue","yellow"),

            group.by ="anno2" , #Seurat数据结构中的meta里的注释细胞的那个列名,Seurat@meta$anno2

            flip = TRUE) +

      theme(legend.position = "none") +

      ggtitle("Identity on x-axis")

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