dotPlotly

作者: ayunga | 来源:发表于2022-04-14 22:19 被阅读0次

1.目的

使用 dotPlotly 可视化 minimap2 或者 mummer 得到的序列比对结果。

2.安装

dotPlotly 其实就是个R程序,运行依赖3个R包。这里就直接搞了个conda环境,把对应的R包装上而已。
dotPlotly 程序从github下就好。

conda create -n dotPlotly r-base
conda activate dotPlotly
conda install r-optparse
conda install r-ggplot2
conda install r-plotly
git clone https://github.com/piyixing/dotPlotly.git

3.使用

conda activate dotPlotly
mummerCoordsDotPlotly.R -h

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