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序列拼接和做完点突变后的序列比对

序列拼接和做完点突变后的序列比对

作者: 很多个故事 | 来源:发表于2019-08-21 23:02 被阅读0次

反向互补(Reverse Complement) - 免费在线工具 http://www.detaibio.com/sms2/rev_comp.html

由于测序一次只测n个bp,不完整,所以需要把几次结果拼接起来才能看到完整的序列,但是测序的前50个和后50个是不准确的,我们需要把不准确的序列剔除,才能连接

将R序列反向互补

用vector NTI打开模板序列和待拼接序列,比较上一个序列和下一个序列相同的地方,一般上一个序列的尾和下一个序列的头的测序是不准确的,需要剔除。

测序后需要观察突变是否正确,一般做两个,这样观察序列看突变的位点可以更清晰,突变的正确与否更能确定。

方法1:snapgene看图谱,有两个峰(测100条DNA序列,50条突变,50条不突变)的是突变正确的(峰代表荧光强度)

方法2:vector NIT看序列上的碱基和模板是否不同

如何在已知突变的氨基酸的条件下,知道是哪个位置上的碱基突变,将模板导入snapgene,view-sequence下面可以看到

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