转录组测序2-测序数据质控

    转录组测序是最常用的组学实验，对全谱基因定量，找到差异表达基因。RNAseq涉及到原始数据，数据质控，基因组比对，差异基因鉴定，差异基因功能富集分析，重要基因如转录因子激酶的靶基因预测等，我们用10讲的时间，全面讲解转录组测序报告，及在上百个项目中遇到的近百个常见问题。

    上一期视频“转录组测序1-测序原始数据说明”中，我们讨论了测序原始的数据。将样品拿去测序获得原始测序数据，原始测序数据是fastq格式的序列文件。存储了RNA的序列信息。我们今天继续看一下，原始数据如何来进行质控，如何过滤掉哪些低质量的，或者说有问题的reads，进行后续的分析。

本节内容要点包括：

（1）测序的下机数据为什么需要过滤，里面包含了怎样的不可靠的序列；

（2）测序接头序列是什么，怎样产生，又该如何去除；

（3）低质量的序列，体现在哪些方面；

（4）常见的数据质控生物信息学工具有哪些；

（5）FastQC的质量评估图，各项内容详解。

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视频教程：

生因生物转录组测序讲解2-数据质控

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