Spark SQL 优化笔记

作者: 董可伦 | 来源:发表于2019-05-30 13:50 被阅读5次

    我的原创地址:https://dongkelun.com/2018/12/26/sparkSqlOptimize/

    前言

    记录自己在工作开发中遇到的SQL优化问题

    1、避免用in 和 not in

    解决方案:

    • 用exists 和 not exists代替
    • 用join代替

    not exists示例

    not in:

    select stepId,province_code,polyline from route_step where stepId not in (select stepId from stepIds)
    

    not exists:

    select stepId,province_code,polyline from route_step where road!='解析异常' and  not exists (select stepId from stepIds where route_step.stepId = stepIds.stepId)
    

    自己遇到的问题

    上面not in会抛出异常

    18/12/26 11:20:26 WARN TaskSetManager: Stage 3 contains a task of very large size (17358 KB). The maximum recommended task size is 100 KB.
    Exception in thread "dispatcher-event-loop-11" java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space
    

    首先会导致某个task数量很大,且总task数量很少(task数目不等于rdd或df的分区数,目前不知道原因),接着报java.lang.OutOfMemoryError,试了很多方法,最后用not exists,没有上面的异常

    效率

    not in慢的原因是 not in不走索引

    疑问:not in是非相关子查询,not exists是相关子查询,而从理论上来说非相关子查询比相关子查询效率高(看下面的参考),但是这里却相反,矛盾,不知道为啥~

    参考博客:

    2、in 会导致数据倾斜

    longitudeAndLatitudes和lineIds都有160个分区,且数据平衡(每个分区的数目差不多),但是下面的语句则有问题

    select * from longitudeAndLatitudes where lineId  in (select lineId from lineIds)
    

    虽然分区数还是160,但是只有两三个分区有数,其他分区的数量都为0,这样就导致数据倾斜,程序执行很慢,如果非要用in的话,那么需要repartition一下

    3、大表join小表

    策略:将小表广播(broadcast)
    参数:spark.sql.autoBroadcastJoinThreshold 默认值10485760(10M),当小表或df的大小小于此值,Spark会自动的将该表广播到每个节点上
    原理:join是个shuffle类算子,shuffle时,各个节点上会先将相同的key写到本地磁盘,之后再通过网络传输从其他节点的磁盘文件在拉取相同的key,因此shuffle可能会发生大量的磁盘IO和网络传输,性能很低,而broadcast先将小表广播到每个节点,这样join时都是在本地完成,不需要网络传输,所以会提升性能

    • 注意:broadcast join 也称为replicated join 或者 map-side join

    具体操作

    提交代码时适当调大阈值,如将阈值修改为100M,具体看自己环境的内存限制和小表的大小

    --conf spark.sql.autoBroadcastJoinThreshold=104857600
    

    如何看是否进行了broadcast join:
    以df为例(df是join之后的结果)

    df.explain
    

    如果为broadcast join,则打印:

    == Physical Plan ==
    *(14) Project [lineId#81, stepIds#85, userId#1, freq#2]
    +- *(14) BroadcastHashJoin [lineId#81], [lineId#42], Inner, BuildLeft
    ...
    

    能看到关键字BroadcastHashJoin即可,否则打印:

    == Physical Plan ==
    *(17) Project [lineId#42, stepIds#85, freq#2, userId#1]
    +- *(17) SortMergeJoin [lineId#42], [lineId#81], Inner
    ...
    

    能看到SortMergeJoin即可

    查看阈值:

    val threshold =  spark.conf.get("spark.sql.autoBroadcastJoinThreshold").toInt
    threshold / 1024 / 1024
    

    参考

    4、写MySQL慢

    Spark df批量写MySQL很慢,如我900万条数据写需要5-10个小时
    解决办法:在url后面加上

    &rewriteBatchedStatements=true
    

    加上之后,写数据10分钟左右,快很多。

    个人环境经验:MySQL不用加就没问题,MariaDB需要加,也就是不同的MySQL版本不一样

    5、run at ThreadPoolExecutor.java:1149

    之前就在Spark Web UI经常看到这个描述,但不知道是干啥,现在在总结上面的broadcast join发现了规律:当两个表join,如果为BroadcastHashJoin则有这个描述,如果为SortMergeJoin则没有。
    BroadcastHashJoin 用ThreadPool进行异步广播 源码见:BroadcastHashJoinExecBroadcastExchangeExec
    参考:What are ThreadPoolExecutors jobs in web UI's Spark Jobs?

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